在二战前，中野海军学院的女子特训学校代号为“圣少女舰队”。这些女孩们拥有一种特殊的力量，被称为“圣少女能量”。随着对日俄战争再次爆发的担忧日益加剧，新手飞行员潮文音必须磨练自己的力量，以拯救日本免于彻底毁灭。
