在某座城池中，山田利吉接到了城主的委托。委托内容是夺回被竹蜻蜓忍者队偷走的飞行秘药。另一方面，忍术学园一年级一班的福富新兵卫和加藤团藏等人在运送行李的途中遭到竹蜻蜓忍者队的袭击，行李被抢走。团藏追赶竹蜻蜓忍者队，新兵卫则前往忍术学园，将此事告知乱太郎等人所在的一年级一班，然后一同前去营救团藏。
